Der Ionisierungsmechanismus bei dem MALDI-TOF (matrix assisted LASER desorption ionisation time of flight) Verfahren beruht auf Analyten, die in ein Kristallgitter eingeschlossen sind. Mit einem Laserimpuls werden Cluster aus der Oberfläche heraus gelöst, wodurch der Analyt in die Gasphase gebracht wird. Das vorherige Einbinden in eine Matrixsubstanz ermöglicht das überführen des Analyten in die Gasphase ohne die Zerstörung durch den Laserimpuls. Je nach Art des Analyten eignen sich verschiedene Matrixsubstanzen besser.
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