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Der Begriff „Proteomics“ ist als eine Analogie zum Begriff „Genomics“ entstanden, und während es oft als „der nächste Schritt“ gesehen wird, ist Proteomics sehr viel komplizierter als Genomics. Während das Genom eine eher statische Einheit darstellt, ist das Proteom von Zelle zu Zelle unterschiedlich und ändert sich laufend durch seine biochemischen Wechselwirkungen mit dem Genom und der Umwelt. Das Proteom ist somit die Gesamtheit an Proteinen, die man zu einem bestimmten Zeitpunkt in einer bestimmten Zelle findet. Proteomics ist dementspechend die Wissenschaft, die sich mit der Untersuchung des Proteoms beschäftigt. Dabei geht es unter anderem um die Proteintrennung, -identifikation und -quantifizierung, aber auch um die Sequenzanalyse von Peptiden. Im Mittelpunkt steht heute die Entwicklung von effizienten Methoden die ein hohes Auflösungsvermögen bieten und dabei gleichzeitig reproduzierbare Ergebnisse liefern.