"Gataca" im E. coli

Oktober 19th, 2006 Autor: Phillip Kroll -

Das Genom von Escherichia coli (der beliebteste Einzeller für jede Art von Untersuchung) ist komplett sequenziert und im Internet frei verfügbar.
Schreibt man ein Perl Programm, dass es ermöglicht, Sequenzen in dem Genom zu suchen, kann man damit ziemlich viele nutzlose Sachen machen. Zum Beispiel nach der Sequenz "gataca" suchen um herauszufinden wie oft sie im Genom vorkommt.

Escherichia Coli Untersuchung Bioinformatik

Und das Ergebnis ist: 632 mal. Hier geht es zum kompletten Genom von E. coli: E. coli Genom (Vorsicht groß)

Den Perl Programmcode gibt es hier

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