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Die meisten Enzyme benötigen für ihre katalytische Aktivität zusätzliche chemische Komponenten. Dabei kann es sich entweder um anorganische Ionen (Fe²⁺, Mg²⁺, Mn²⁺ oder Zn²⁺) oder um komplexere organische oder metallorganische Moleküle handeln. Im letzteren Fall spricht man von Koenzymen, eine Untermenge der Kofaktoren. Sind Kofaktoren fest an ein Enzym gebunden, bezeichnet man sie auch als prosthetische Gruppe. Enzyme die durch Bindung an all ihre Kofaktoren ein aktives Enzym bilden werden als Holoenzyme bezeichnet. Liegt das Enzym ohne seine Kofaktoren, also katalytisch inaktiv vor, bezeichnet man es als Apoenzym.