Einführung in Systemmodellierung mit SBML

Juni 21st, 2007 Autor: Phillip Kroll -

Ein Vortrag über SBML (System Biology Markup Language) für das Fach Gsim (Graphische Simulation)

Inhalte

  • Allgemeines (Motivation, Was gibt es?, Was ist SBML? und was nicht?, SBML besteht aus Ebenen, SBML Level 2, Features von SBML Level 2, Elemente in SBML Modellen, Für Programmierer: libSBML)
  • Das Eingemachte (SBML Dokumente, SBML Modelle im JDesigner, SBML Code für reactions)
  • Modelle simulieren (Zeitverlauf, Zeitverlauf Simulation, Steady State Berechung, Reversible Massenreaktion, SBML Code, Enzymkinetik, Zusammenfassung, Quellen)

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